Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChgaP26339 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms