Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RdxP26043 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RdxP26043 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RdxP26043 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RdxP26043 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RdxP26043 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RdxP26043 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RdxP26043 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RdxP26043 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms