Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms