Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfkb1P25799 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms