Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh1a1P24549 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a1P24549 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms