Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms