Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms