Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms