Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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