Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms