Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms