Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01791 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01791 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01791 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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