Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01665 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01665 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms