Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mtatp6P00848 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms