Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Ccl20O89093 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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