Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shoc2O88520 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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