Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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FxnO35943 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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FxnO35943 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FxnO35943 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FxnO35943 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FxnO35943 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FxnO35943 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FxnO35943 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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FxnO35943 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FxnO35943 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FxnO35943 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FxnO35943 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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