Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms