Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms