Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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