Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms