Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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