Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn20G5E8X0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn20G5E8X0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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