Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms