Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arid4aF8VPQ2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms