Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccdc71lE9Q4T4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccdc71lE9Q4T4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccdc71lE9Q4T4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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