Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms