Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms