Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbf2E9PXF8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms