Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gimd1E9PW74 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gimd1E9PW74 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gimd1E9PW74 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gimd1E9PW74 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gimd1E9PW74 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gimd1E9PW74 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms