Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde2E9PUP1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms