Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms