Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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