Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms