Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms