Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms