Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms