Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms