Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms