Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ckap5A2AGT5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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