Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc163A2AGD7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms