Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms