Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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