Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms