Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms