Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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