Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms