Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms