Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms