Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms